Le Secrétaire général assure la gestion administrative et financière de l’OCLEI. Il anime les services techniques qui préparent et instruisent les dossiers à l’attention du Président de l’OCLEI. Il comprend un personnel administratif et technique composé de fonctionnaires mis à disposition, de magistrats en détachement et de contractuels.Le Secrétariat général est dirigé par un Secrétaire général nommé par décret pris en Conseil des Ministres sur proposition du Président de l’Office.Le Secrétariat général comprend :

• le Gestionnaire ;
• le Service juridique ;
• la Direction des systèmes d’information ;
• le Service de la Documentation et des Archives ;
• le Secrétariat particulier du Secrétaire général ;
• le Pool de secrétariat. 

 LES SERVICES EN STAFF AUPRÈS DU PRÉSIDENT DE L’OCLEI SONT COMPOSÉS DE :

• l’Agence comptable ;
• l’Unité des Plaintes et des Dénonciations ;
• la Direction des systèmes d’information ;
• le Service de l’Audit interne ;
• le Service de la Communication ;
• le Service de la Sécurité ;
• le Service du Protocole et de l’Appui à la Coopération ;
• la Régie d’avance;
• le Secrétariat particulier du Président.